Kongsspir er en 30-80 cm høy, ofte rødaktig, flerårig plante med opprette og glatte stengler. De nedre bladene er samlet i en rosett og er lansettformede og fjærflikete, av og til noe hårete på undersiden. Stengel-bladene er få og spredte.

Planten blomstrer i juni-august med lysegule blomster med rødaktig kant på underleppen. Blomstene er halvt opprette, 22-32 mm lange og sitter i et langt åpent, fåbladet aks. Kronesvelget er som oftest lukket, og underleppen omslutter delvis overleppen. Planten kjennes lett igjen på de nesten bladløse stenglene og de lukkede blomstene, og kan neppe forveksles med andre arter.

Kapselen er nesten kulerund.

Planten vokser på våt, næringsrik jord, som på elvestrender, i myrkanter, våt eng, kratt og fuktig skog. Kongsspir er å finne spredt nord til Finnmark, i sørligere deler av landet mest i fjellet. Planten mangler helt på Sør- og Vestlandet.